MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 43995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013416	ATT	2	6	171042	171047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013416	T	6	6	171046	171051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013416	CAA	2	6	171091	171096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013416	CGG	2	6	171194	171199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866905
3505	NC_013416	CAA	2	6	171239	171244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866905
3506	NC_013416	CGT	2	6	171285	171290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3507	NC_013416	ACG	2	6	171350	171355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3508	NC_013416	CTT	2	6	171358	171363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866905
3509	NC_013416	CTT	2	6	171406	171411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866905
3510	NC_013416	TCA	2	6	171466	171471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
3511	NC_013416	CAT	2	6	171487	171492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
3512	NC_013416	CGC	2	6	171502	171507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866905
3513	NC_013416	TTGA	2	8	171545	171552	25 %	50 %	25 %	0 %	261866905
3514	NC_013416	TCG	2	6	171573	171578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3515	NC_013416	CCG	2	6	171637	171642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866905
3516	NC_013416	TGG	2	6	171652	171657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866905
3517	NC_013416	TTC	2	6	171674	171679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866905
3518	NC_013416	AGC	2	6	171810	171815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3519	NC_013416	TCAAAA	2	12	171816	171827	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261866905
3520	NC_013416	CAAA	2	8	171835	171842	75 %	0 %	0 %	25 %	261866905
3521	NC_013416	CGT	3	9	171937	171945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3522	NC_013416	CAC	2	6	171953	171958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866905
3523	NC_013416	CAT	2	6	171974	171979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
3524	NC_013416	ACG	2	6	172006	172011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
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3527	NC_013416	T	6	6	172232	172237	0 %	100 %	0 %	0 %	261866905
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3531	NC_013416	TGGTGT	2	12	172471	172482	0 %	50 %	50 %	0 %	261866905
3532	NC_013416	CCA	2	6	172495	172500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866905
3533	NC_013416	AAC	3	9	172554	172562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866905
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3536	NC_013416	GTT	2	6	172612	172617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866905
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3540	NC_013416	TAA	2	6	172858	172863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866905
3541	NC_013416	GGC	2	6	172955	172960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866905
3542	NC_013416	TTG	2	6	172962	172967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866905
3543	NC_013416	CGG	2	6	172978	172983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866905
3544	NC_013416	TGA	2	6	173035	173040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866905
3545	NC_013416	TTG	4	12	173108	173119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866905
3546	NC_013416	GATC	2	8	173287	173294	25 %	25 %	25 %	25 %	261866906
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3549	NC_013416	AGG	2	6	173410	173415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013416	TGA	2	6	173465	173470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013416	TA	3	6	173504	173509	50 %	50 %	0 %	0 %	261866907
3552	NC_013416	AGT	2	6	173648	173653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866907
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3554	NC_013416	GTAA	2	8	173741	173748	50 %	25 %	25 %	0 %	261866907
3555	NC_013416	TTA	2	6	173800	173805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866907
3556	NC_013416	ACACCA	2	12	173941	173952	50 %	0 %	0 %	50 %	261866907
3557	NC_013416	T	6	6	174033	174038	0 %	100 %	0 %	0 %	261866907
3558	NC_013416	TAT	2	6	174187	174192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013416	GCC	2	6	174200	174205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_013416	C	6	6	174204	174209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3561	NC_013416	ATT	2	6	174231	174236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013416	CAT	2	6	174243	174248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013416	ATT	2	6	174252	174257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013416	TGC	2	6	174269	174274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866908
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3570	NC_013416	TGA	2	6	174467	174472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866908
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3572	NC_013416	TGA	2	6	174512	174517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866908
3573	NC_013416	CG	3	6	174555	174560	0 %	0 %	50 %	50 %	261866908
3574	NC_013416	GTT	2	6	174572	174577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866908
3575	NC_013416	GTA	2	6	174579	174584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866908
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3582	NC_013416	CG	3	6	174741	174746	0 %	0 %	50 %	50 %	261866908
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3588	NC_013416	A	6	6	174957	174962	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
3589	NC_013416	TGATG	2	10	175019	175028	20 %	40 %	40 %	0 %	261866908
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3594	NC_013416	TGG	2	6	175381	175386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866908
3595	NC_013416	GCG	2	6	175416	175421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866908
3596	NC_013416	A	7	7	175468	175474	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
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3599	NC_013416	TCAA	2	8	175732	175739	50 %	25 %	0 %	25 %	261866908
3600	NC_013416	GGCG	2	8	175754	175761	0 %	0 %	75 %	25 %	261866908
3601	NC_013416	CGG	2	6	175768	175773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866908
3602	NC_013416	CAA	2	6	175800	175805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866908
3603	NC_013416	GCT	2	6	175871	175876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866908
3604	NC_013416	GT	3	6	175879	175884	0 %	50 %	50 %	0 %	261866908
3605	NC_013416	TGAT	2	8	175912	175919	25 %	50 %	25 %	0 %	261866908
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3607	NC_013416	TGC	2	6	176068	176073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866908
3608	NC_013416	A	6	6	176074	176079	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
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3610	NC_013416	TGG	2	6	176155	176160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866908
3611	NC_013416	CCT	2	6	176245	176250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866908
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3613	NC_013416	GGC	2	6	176275	176280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866908
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3620	NC_013416	TTC	2	6	176762	176767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866908
3621	NC_013416	CCG	3	9	176827	176835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866908
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3854	NC_013416	AC	3	6	188560	188565	50 %	0 %	0 %	50 %	261866921
3855	NC_013416	CGCAA	2	10	188568	188577	40 %	0 %	20 %	40 %	261866921
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3859	NC_013416	CAAGC	2	10	188926	188935	40 %	0 %	20 %	40 %	261866921
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3992	NC_013416	T	7	7	196318	196324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3993	NC_013416	TGC	2	6	196365	196370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866929
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3996	NC_013416	T	6	6	196438	196443	0 %	100 %	0 %	0 %	261866929
3997	NC_013416	GCG	2	6	196447	196452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866929
3998	NC_013416	TCT	2	6	196529	196534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866929
3999	NC_013416	T	7	7	196620	196626	0 %	100 %	0 %	0 %	261866929
4000	NC_013416	T	6	6	196682	196687	0 %	100 %	0 %	0 %	261866929

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